兵团眼科中心成立于2021年1月11日，是兵团卫生健康委正式批准成立的省级医学中心。兵团眼科中心的成立标志着以兵团眼科中心为核心的兵团系统各师医院、团场医院的眼科工作将纳入统筹规划、协作管理的体系。兵团眼科中心将借助医共体及眼科专科联盟等形式，通过医疗、教学、科研、人才培养、信息化等全方位建设，在空间布局、学科建设、人才引进和培养、临床医疗服务能力、中西医结合眼病诊治探索、科研创新等方面都已形成规模，将兵团眼科中心打造成为集管理、防盲、临床、教学、科研为一体的全疆一流、国内领先的眼科中心，带动兵团所属的17家师医院眼科医疗服务同质化、规范化发展，为各师医院建立顺畅的转诊通道，同时将基本眼病筛查等公共卫生服务下沉和延伸，为各族人民的眼健康提供优质医疗服务，推进兵团眼健康事业高质量发展。兵团眼科中心现有医生18名，技师4名，护士20名，计划设立五个病区：白内障青光眼、眼底病、儿童眼病、日间手术、泪器眼眶及斜视病区。目前能够开展白内障、青光眼、玻璃体视网膜疾病、葡萄膜疾病、神经眼科疾病、眼外伤、斜视矫正、泪器疾病、眼眶病、角膜移植及儿童眼病等各种眼科常规及复杂手术。与北京协和医院、北京医院、天津市眼科医院、中山大学中山眼科中心、厦门市眼科中心、上海复旦眼耳鼻喉科医院、空军军医大学西京医院、西安第四人民医院等国内知名医院眼科有人才培训合作。目前兵团眼科中心不仅是兵团医学会眼科学分会主委单位，而且是北京协和医院眼科专科医联体成员单位，北京协和医院眼科阅片中心兵团眼科分中心，也是兵团眼科专科联盟、兵地眼科专科联盟的核心单位。